財務匯報局的經費由四間機構分攤，它們是公司註冊處營運基金、證券及期貨事務監察委員會、香港交易及結算所有限公司及香港會計師公會。四間機構已同意平均分攤費用，並就下列安排簽署了諒解備忘錄：